Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POTEB3A0JP26 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms