Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PFDN4Q9NQP4 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PFDN4Q9NQP4 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms