Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms