Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms