Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms