Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FSCN1Q16658 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms