Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CTF1Q16619 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CTF1Q16619 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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CTF1Q16619 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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CTF1Q16619 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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