Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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