Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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