Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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