Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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