Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CUL1Q13616 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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