Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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