Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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