Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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