Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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