Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXA13P31271 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXA13P31271 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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