Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPREP23469 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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