Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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