Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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