Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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