Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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