Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms