Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPREP23469 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms