Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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HOXA5P20719 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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HOXA5P20719 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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HOXA5P20719 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA5P20719 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA5P20719 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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