Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNRPB2-201ENST00000246071 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SNPHO15079 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SNPHO15079 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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