Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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