Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RYR3Q15413 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RYR3Q15413 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms