Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NFIXQ14938 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms