Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms