Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NCOA4Q13772 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms