Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms