Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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CLN3Q13286 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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CLN3Q13286 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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