Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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