Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PDE4DQ08499 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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