Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CENPFP49454 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CENPFP49454 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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