Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC025518.2-201ENST00000605229 492 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 ZNF544-220ENST00000627781 383 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 RPL23AP7-202ENST00000416673 2078 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PLP1-221ENST00000619236 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PLEKHM3-204ENST00000457206 3689 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 ARNTL2-202ENST00000266503 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 EXOSC2-211ENST00000546165 1956 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 ENPP6-201ENST00000296741 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 ELOB-201ENST00000262306 582 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 LINC01120-201ENST00000437751 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 IGKV1-16-201ENST00000479981 378 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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HOXD11P31277 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
HOXD11P31277 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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