Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRGP23470 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms