Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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TRHP20396 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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TRHP20396 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TRHP20396 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TRHP20396 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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