Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms