Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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