Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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