Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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