Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK2Q16620 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK2Q16620 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms