Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
USF2Q15853 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
USF2Q15853 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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