Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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