Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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