Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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