Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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