Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CUL4AQ13619 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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